Pour l'instant, l'obtention de ce certificat semble gratuite. Cependant, l'agriculteur finance sa formation. Un Certiphyto coûte 260 euros en moyenne par personne. Le montant de la cotisation est de 65 euros en moyenne et 75 % des exploitants cotisent à hauteur de 43 euros par an. La cotisation maximale s'élève à 260 euros.