La recherche d'efficience pourrait-elle permettre de refuser la commercialisation ou le remboursement d'un médicament nouveau, et dont le prix est de ce fait plus élevé, mais qui n'apporte pas d'amélioration thérapeutique par rapport à d'autres médicaments déjà présents sur le marché ? La certification prend-elle en compte l'environnement des établissements, et notamment leur caractère d'établissements de proximité ? La fermeture d'un hôpital de campagne qui ne répond pas aux exigences de la certification peut laisser un territoire dans une situation difficile.