Cet argent est en effet sorti du budget, en 2010 pour le PIA 1, en 2014 pour le PIA 2, et déposé sur un compte auprès du Trésor dont le titulaire est l'Agence nationale de la recherche (ANR). Les initiatives d'excellence sont construites autour de deux périodes. La première, probatoire, où l'argent est toujours la propriété de l'État est suivie d'une seconde où le capital, sans quitter le compte de l'ANR, devient juridiquement la propriété de l'université, selon un mécanisme de dévolution.