La recherche scientifique consiste à utiliser des sous-marins et des robots opérés à distance ou autonomes. Il est possible de procéder à de la collecte d'échantillons à la pince, en étant très peu intrusif. La technique de l'ADN environnemental permet de savoir, grâce à des techniques de filtration, quelles espèces sont passées dans les eaux analysées.
L'exploration est en revanche intrusive et destructrice. Il s'agit de tester les gisements en descendant avec un collecteur du même type que les machines qui serviront à l'exploitation. D'où le parallèle avec l'exploration pétrolière. En parallèle, on essaie de mesurer et de comprendre l'impact de cette collecte sur le fond marin et le sédiment. L'exploration n'est intrusive que lorsqu'on mesure notre capacité à détruire.