Selon un schéma vaccinal à deux injections, sauf pour la tranche des personnes âgées, compte tenu de la compliance observée lors des vaccinations contre la grippe saisonnière - 65 % des populations cibles - et du taux de vaccination contre la méningite B en Seine-Maritime - plus de 85 % -, il a été considéré que 25 % de la population ne se feraient pas vacciner. On a donc acquis 94 millions de doses, pour 47 millions de vaccins. A l'époque, le 23 juillet 2009, 67 % de la population disaient leur intention de se faire vacciner, M. François Autain, président, notant que, selon M. Michel Setbon, un tel taux d'intention pouvait se réduire à 30 % environ de vaccinations effectives.