Concernant l'innovation, 2 milliards d'euros seront consacrés à l'Agence pour l'innovation industrielle d'ici à 2007 et 1, 5 milliard d'euros seront consacrés aux contrats de plan Etat-région.
Par ailleurs, le ministère de l'économie, des finances et de l'industrie a bâti, avec le ministère des transports, de l'équipement, du tourisme et de la mer un plan de financement ambitieux en faveur de l' AFITF, l'Agence de financement des infrastructures de transport de France.