Le système des avances remboursables serait beaucoup plus coûteux : l'État fait une avance à l'entreprise, qui ne la rembourse que si elle obtient le marché. En cas d'insuccès, l'État a perdu les fonds investis.
Le CIR n'est pas lié à un produit particulier : le but du dispositif est d'inciter les entreprises à engager des dépenses de recherche, très en amont de la mise sur le marché. Assurer une telle traçabilité me semble contraire à l'esprit même du dispositif.