La mésentente est le fruit de l'histoire. Il y a eu trop d'affrontements et d'actes de violence ; le sentiment d'identité religieuse est passé au second plan par rapport à l'identité nationale. Les gens du Sud ont vu ce qui s'est passé au Darfour, ils constatent que Khartoum est au ban de la communauté internationale et ils veulent l'indépendance. Enfin, n'oublions pas les ambitions des dirigeants. Le Sud représente 40 % du territoire mais 15 % de la population, 2 à 3 % des Sudistes vivant au Nord ; au Soudan, le PIB par habitant est de 2 000 dollars par an, mais il ne représente dans le Sud que 15 à 20 % de celui du Nord. Le Sud est sous-équipé, il n'y a pas de route, ni de téléphone.