En réponse à ces intervenants, M. Daniel Raoul, rapporteur pour avis, a estimé que seuls réussiront les pôles de compétitivité ayant su, tels les technopôles, faire converger les collectivités territoriales, les universités et les industries. M. Michel Houel, rapporteur pour avis, a pour sa part précisé que l'évaluation des pôles de compétitivité effectuée sous l'égide de la Délégation interministérielle à l'aménagement et à la compétitivité des territoires (DIACT) et rendue publique en juillet 2008 avait conclu que sur les 71 pôles de compétitivité, 36 atteignaient leurs objectifs, 22 les atteignaient partiellement et 13 devaient être reconfigurés.
Puis, suivant la suggestion de M. Michel Houel, rapporteur pour avis, la commission a donné un avis favorable à l'adoption sans modification des crédits pour 2009 de la mission « Recherche et enseignement supérieur », M. Daniel Raoul, rapporteur pour avis, ayant réitéré son opposition à la structure de ces crédits. En outre, conformément aux recommandations de ses deux rapporteurs pour avis, elle a également donné un avis favorable à l'adoption des articles 66, 66 bis et 66 ter du projet de loi de finances rattachés à la mission.